Hari Rabu, 23 Desember 2009 sudah dilakukan rapat senat tertutup (oleh 16 anggota senat STAIN Salatiga ) untuk memilih Ketua STAIN Salatiga 2010-2014 dengan hasil sebagai berikut: 

1. Dr. Imam Sutomo, M. Ag. memperoleh 8 suara
   
2. Dr. H. Muh Saerozi, M. Ag. memperoleh 6 suara
   
3. Rohmat, Ph. D memperoleh 0 suara
   
4. Prof. Dr. H. Budihardjo, M. Ag memperoleh 2 suara

Hasil ini pada hari senin,. 28 Desember 2009 akan disampaikan ke Menteri Agama RI untuk mendapatkan Surat Keputusan (SK) MENAG